本校創校於民國元年，曾為南靖糖廠日本員工子弟就讀的學校。校園前庭的老芒果樹，是昔日學子最佳休憩處所。高大的大王椰子及可可椰子樹，矗立在校園的許多角落，顯露出熱帶南洋風味的景緻；而具有濃厚鄉土氣息的榕樹群，是校園裡遮陽乘涼的好地方。 本校校舍雖然老舊，但是我們擁有綠意盎然的草地、美不勝收的花圃以及歷年來全體師生共同努力的綠化、美化成果和創意裝置。綠色永續校園親近大自然的南靖~ 校園裡處處蟲鳴鳥叫的聲音，增添了每個人不一樣感覺。雖然本、分校校地都不大，校舍也老舊，可是，校園內繁花點點、處處綠意盎然。這種鳥語花香的自然風采，呈現出南靖國小特有的生態環境，而且也足以提供學子不斷地去探索和學習。